Bilim insanları, [Au6{1,2-C6H4(OCH2CC)2}3{Ph2P(CH2)4PPh2}3] formülüyle kendi kendine birleşip düğüm oluşturan bir kimyasal geliştirdi ve bu sayede en küçük ve en sıkı moleküler düğüm rekorunu kırdı. Bu molekülün geliştiricileri, başlangıçta altı altın atomunu vurgulayarak molekülün tamamını Au6 olarak isimlendiriyor.
Bir molekülün başkalarını etkileme hali sadece onu oluşturan elementlere değil, tıpkı vakitte bunların ne formda birleştiğine de bağlı. Karmaşık moleküller çok farklı formlarda katlanabilir ve bazen bunlardan yalnızca biri istenen biyolojik tesirleri üretebilir. Bu çeşit katlanmaları kestirim etmek ve denetim etmek, bilimdeki en sıkıntı sıkıntılardan biri olarak kabul ediliyor ve bu sorunun tahlilinde, bilgisayarlar, insanların yerini almaya başlıyor.
Düğümler bunun en uç noktasını temsil ediyor. Uzun ince atom şeritlerini bile düğümlemek kolay bir şey değil. Molekülleri düğümlemenin yollarını bulmak, insanlığın daha pratik düğümleme kapasitesinin geliştirilmesine yardımcı olabilir. DNA, RNA ve birçok protein insan müdahalesi olmadan düğümlendiğinden ötürü, bilim insanlarının kendi düğümlemelerini yapabilmesi, bu hayati moleküllerin davranışlarını anlamamıza yardımcı olabilir.
Düğümler geçiş sayısına nazaran sınıflandırılır. Au6, üç geçişli, değersiz olmayan düğümün en kolay tipini oluşturur ve yonca olarak bilinir. Kimyacılar moleküler düğümlerin sıkılığını fizikî manada ölçemediklerinden ötürü, düğümlü iplikçikteki atom sayısını geçiş sayısına bölerek temsili olarak kullanırlar. Geçiş başına ne kadar az atom varsa, düğüm o kadar sıkı olur.
Western Ontario Üniversitesi’nden Profesör Richard Puddephatt’ın da ortalarında bulunduğu bir takım tarafından üretilen Au6’da sırf 54 atom bulunuyor. Bu, 69’luk bir evvelki rekorla karşılaştırılırken, 76’dan az atomdan oluşan organik yonca düğümüne ulaşılamadı. Çok daha büyük düğümler ve çok daha fazla geçiş, 24’e kadar düşük sıkılık skorlarına ulaştı fakat Au6’nın 54 atomu ve 18’lik sıkılık skoru, şu ana kadar oluşturulanların tamamını kolaylıkla geride bırakabiliyor. Teorik modeller bir düğüm için en az 50 atomun olabileceğini öne sürüyor.
Au6, daha evvelki çalışmalardan farklı formda yapıldı ve Puddephatt, New Scientist’e yaptığı bir açıklamada, bunun bir “kaza” olduğunu söyledi. Farklı moleküller içeren iki sıvıyı, birbirine bağlı lakin düğümlenmemiş, katenan ismi verilen zincirlere sahip yapılar oluşturmak için karıştırıyorlardı. Eseri incelemek için X-ışını kristalografisini kullanarak, katenanlardan kimilerinin zaten yonca düğümleri halinde birleştiğini gördüler.
Puddephatt, “Altın asetilidler ve fosfin ligandlarının birçok kombinasyonunu yaptık ve bunlara daha evvel hiç yonca düğümü oluşturmamıştı” dedi ve ekledi: “Bu durumda bunun olacağını iddia etmemiştik, bu yüzden tesadüf oldu.”
Çalışma Nature Communications’da yayınlandı.